曹操现在有了兵马，有了地盘，但马上有了个很现实的问题，就是这么多人你如何安置，如何养活？毛玠在这个时候就体现出他是一个重要的谋士的价值，他向曹操提出了一个战略性的意见。
青州黄巾军不是还有六七十万不能打仗的随军家属吗？这个青黄巾军是个奇怪的军事组织，它整体来说并不是一个纯粹的准军事化组织，它还有许多的随军家属和农民，就是当时的青州的黄巾军战斗人员是三十多万，非战斗人员的随军家属和农民加起来一共有六七十万，两者加起来这黄巾军还真有一百多万，而且那些随军家属和农民还随身带着农具、耕牛等耕作用品。仅在无盐县战斗结束后，曹军就在县城内收缴黄巾军农耕用具十几万件，耕牛三千多头。
毛玠建议曹操安排这些人开荒种田，自食其力。这些随军家属和农民打仗肯定是滥竽充数，但种庄稼倒是行家里手。如果能发挥这些人的特长，今年秋天他们就能向曹操的军队提供一部分军粮。
其实，这也是后来为曹操大规模实行“屯田”的一种实验，毛玠的建议已经具备一个这种形式的雏形。
毛玠认为现在曹操必须修耕植、蓄军资。说到扩充军队所需的军资，曹操和曹智心照不宣的笑了。钱！他们不缺，身边带的加谯县老家藏得，绝对够付面前这六十万军队几年的军饷。在兖州平定后，曹操就让乐进、李典带人回谯县分批运送财宝到鄄城和宛陵，黄巾军收服，兖州到手，接下来的先期治理就需要大量用钱了。
当然，要长治久安还是要听取毛玠的意见，除了经济实力的比拼以外，战争作为政治的延续，还要比拼政治实力，政治实力靠什么呢？靠正义的旗帜，毛玠主张曹操必须表现自己是师出有名，是堂堂正正的正义之师，至少必须有一面正义的旗帜。
这面旗帜，目前毛玠还没说到、想到要“挟天子以令诸侯”，这么高深的政治觉悟。他倡导曹智应当“遵奉天子”，这个遵奉的意思，就是说你得跟现在的长安政府搞好关系，让皇帝或则是挟持皇帝的人对你有好感，以达到曹操现在迫切需要的正归圣命，有了皇帝或是中央政府的肯定，曹操这个兖州牧才是合法的，以后做事才能名正言顺。
毛玠说的这些其实的确非常重要，作为想成为一个深谋远虑的政治家的曹操来说，现在缺的就是有人来为他指明政治方向。
曹操对毛玠非常赏识“敬纳其言”，马上实行他所建议的一切施政纲领。派从事王必出使长安，目的是向献帝表示忠诚，和沟通自己与朝廷当权者李傕、郭汜的关系。尽管他知道自己和李傕、郭汜的关系很糟。李傕、郭汜对他的疑忌太深了，以前甚至于是你死我活的对手。曹智自己也不怎么看好此次王必的长安之行，但为了鼓励毛玠的战略性建议，他还是做了。
接着曹操又准备实施毛玠的“修耕植”发展农业生产的经济策略。连曹操都认为这很重要，他告诉曹智和属下“定国之术，在于强兵足食”。
但曹智没告诉他，自己在丹阳已经比曹操先一步建立了科学和带有资本性质的屯田体系，曹操要到建安元年才实行的《屯田令》，其实曹智已经在丹阳实施了，甚至还加以了改进。
曹智对毛玠初具屯田色彩的建议加以了深化，再在私底下告诉了曹操。曹操也是眼前一亮，非常欣赏弟弟对施政纲领的转化和深化。
于是在曹智的加工建议下，曹操等于是在兴平元年提前开始了屯田令计划。
东汉末年，因为连年的战争，许多土地都已经没有业主了，也没有人耕种。无主田亩收归国有，也就是说统统收给了曹操的兖州政府所有。然后把这些田地拿出来一部分交给自己的军队和黄巾军投降的那些士兵去耕种，叫做军屯，还有一部分招募了那些失地的农民，那些流民来耕种叫民屯。耕牛和农具是由政府提供，然后军人和农民向政府交五成到六成的地租，这个就叫做屯田。屯的意思就是居住方式军事化，耕作方式集体化。也就是说，曹操建设了一个古代的生产建设兵团，曹操的军政府就变成了农场主。
这是一个非常高明的政策，也是一笔非常合算的买卖：第一，土地是人家丢下来的，耕牛和农具是从黄巾军那里缴获的，曹操没有一点本钱的投入，是一种几乎无成本的生意；第二点，收五成到六成的地租，这是高利，因为汉代初年定下的地租是十五分之一，后来汉朝最强盛、鼎盛收得最少的时候甚至到了三十分之一，曹操现在变成了二分之一，暴利。但是对于士兵和农民来说现在有饭吃了，总比原来饿肚子好，所以大家也愿意。曹智也曾建议少收点地租，但被毛玠、程立等谋士反对，他们认为将来曹操的州府、军队，还有随时可能的战争都是急需耗费粮食的，情愿现在多收，也不能因为缺粮而面临政府危机；第三，屯田制度是居住方式军事化、耕作方式集体化，这就等于建设了一个军民合一的新社会，和一支耕战合一的新军队，这些人平时能干，急时能战，既是兵源，又是粮库，岂不是一举两得，而且还解决了一个让人头疼的流民问题，这已经是一举多得的政策计划。
曹操升任毛玠为幕府功曹，委以重任，让他具体监督屯田的实施。
曹智也在兖州诸事稍定后，启程回了丹阳。一路上曹智老在嘀咕，曹操现在有了毛玠、程立、荀彧等人，应该就要飞黄腾达，一帆风顺了。虽说这也是曹智所期盼的，但他经过这么多年在曹家，在三国这个大环境的历练和熏陶，他也早已不满足碌碌无为的过一生，总希望自己也能有更大的建树。